Decorre o ano 2029 e os seres humanos evoluídos mecanicamente foram considerados párias e vivem totalmente marginalizados e isolados do resto da sociedade.
Adam Jensen é agora um operacional experiente, infiltrado num mundo que tem vindo a desprezar a sua classe. Equipado com um novo arsenal de armas e evoluções de última geração, Adam terá que escolher a estratégia certa e em quem confiar para descobrir uma vasta conspiração de escala global.