Em cada uma das cem salas disponíveis traz um desafio diferente, aproximando o jogo de um party game. São minigames, quizes e, obviamente, muitas batalhas. Há também elementos de RPG: conforme progride, você ganha pontos de evolução que deve distribuir entre cada personagem, aumentando assim a força de seus golpes e ganhando novos jutsus (habilidades).
Os combates funcionam como no jogo anterior, com lutas um contra um, dois contra um, dois contra dois e por aí vai. Além dos ataques básicos, pulo e shuriken, há também os ataques especiais, que exigem um processo de carregamento de chakra para serem realizados.