O jogo inicia-se tal qual o livro, com um assassinato misterioso no museu do Louvre. Este evento cedo conduz o enredo do jogo até um autentico maremoto de conspirações, sociedades clandestinas e, mais importante que tudo isto, a um segredo escondido nas pinturas do mestre Leonardo Da Vinci.
Em The Da Vinci Code, os jogadores assumem o papel de duas personagens distintas, o doutor Robert Langdon e Sophie Neveu, neta da única pessoa que conhecia "o segredo". Com elas, vão deambular por vários locais históricos das cidades de Paris e de Londres, como o Louvre, a igreja de St. Sulpice ou ainda a Westminster Abbey.
Enquanto irão vasculhar as cidades à procura de respostas para os seus mistérios, os jogadores terão de procurar também fugir a um grupo de perseguidores que não quer ver a verdade vir ao de cima. Uma dupla missão que junta a estratégia mental e os puzzles à acção de uma bela fuga.
